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      第四軍醫大研制低密度寡核苷酸基因芯片

      更新時間: 2006-04-27 08:45:48來源: 粵嵌教育瀏覽量:478

             第四軍醫大學預防醫學系郭國禎教授等人采用輻射生物學效應原理,應用Mprobe軟件設計探針篩選參與輻射生物學效應基因,日前成功研制出一款由143個基因組成的電離輻射相關低密度寡核苷酸基因芯片。該芯片為檢測不同輻射敏感性腫瘤細胞的差異表達基因提供了一個新的技術平臺。

             基因芯片作為一門新興技術,其具有高通量、微型化和自動化等特點,被廣泛用于各種組織的表達譜分析。近年來,它主要在電離輻射領域用于檢測輻射誘導的相關基因。但由于高密度芯片針對性不強等原因而影響了該技術的研究和發展。

             為研制一種用于放射領域研究的基因芯片,郭萬鋒等人選擇了與輻射效應相關的人類細胞凋亡基因、細胞周期基因及DNA損傷修復基因等作為候選基因,通過對寡核苷酸的合成、肺腺細胞(A549)和肺小細胞癌細胞(NCI-H446)的培養、基因芯片的雜交、洗滌以及對差異表達基因的檢測等技術手段處理后,成功地研制出這款輻射相關低密度寡核苷酸基因芯片。

             研究人員采用RT-PCR檢測發現該基因芯片共含有基因143個,其中輻射相關基因127個,對照基因16個;芯片雜交中出現286個雜交點,平均每個基因兩個;在不同輻射敏感性的A549和NCI-H446細胞中,研究人員篩選出18個差異表達基因,經檢測與芯片結果一致,具有較好的可信度。該結果提示低密度寡核苷酸基因芯片有較好的敏感性、特異性和重復性,可檢測不同輻射敏感性腫瘤細胞的差異表達基因。

             據郭國禎介紹,基因芯片技術的應用雖然越來越廣泛,但目前國內仍然還沒有一種適用于放射研究領域的基因芯片。現有的高密度芯片,存在針對性不強、實驗資料繁雜、不利分析運作和耗費高等問題。因此,此次研制的輻射低密度寡核苷酸基因芯片去掉了眾多的干擾因素,有利于生物信息學分析,可篩選出不同輻射敏感性腫瘤細胞的差異基因,對于從分子水平理解腫瘤細胞的輻射抗性具有重要作用,該芯片也提供了放射研究領域的一個嶄新技術平臺。

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